Hokkaido University

Institute for Chemical Reaction Design and Discovery

2024年

• Virological Characteristics of a SARS-CoV-2-Related Bat Coronavirus, BANAL-20-236
  S. Fujita, A. Plianchaisuk, S. Deguchi, H. Ito, N. Nao, L. Wang, H. Nasser, T. Tamura, I. Kimura, Y. Kashima, R. Suzuki, S. Suzuki, I. Kida, M. Tsuda, Y. Oda, R. Hashimoto, Y. Watanabe, K. Uriu, D. Yamasoba, Z. Guo, A. Jr, Y. Kosugi, L. Chen, L. Pan, Y. Kaku, H. Chu, F. Donati, S. Temmam, M. Eloit, Y. Yamamoto, T. Nagamoto, H. Asakura, K. Sadamasu, K. Yoshimura, Y. Suzuki, J. Ito, T. Ikeda, M. Nagashima, S. Tanaka, K. Matsuno, T. Fukuhara, K. Takayama, K. Sato, EBIOMEDICINE, 2024, 104,
  DOI: 10.1016/j.ebiom.2024.105181
  
• Involvement of SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Immunopathogenesis
  H. Ito, T. Tamura, L. Wang, K. Mori, M. Tsuda, R. Suzuki, S. Suzuki, K. Yoshimatsu, S. Tanaka, T. Fukuhara, MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY, 2024, ,
  DOI: 10.1111/1348-0421.13157
  
• Virological Characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron EG.5.1 Variant
  S. Tsujino, S. Deguchi, T. Nomai, M. Padilla-Blanco, A. Plianchaisuk, L. Wang, M. Begum, K. Uriu, K. Mizuma, N. Nao, I. Kojima, T. Tsubo, J. Li, Y. Matsumura, M. Nagao, Y. Oda, M. Tsuda, Y. Anraku, S. Kita, H. Yajima, K. Sasaki-Tabata, Z. Guo, A. Hinay, K. Yoshimatsu, Y. Yamamoto, T. Nagamoto, H. Asakura, M. Nagashima, K. Sadamasu, K. Yoshimura, H. Nasser, M. Jonathan, O. Putri, Y. Kim, L. Chen, R. Suzuki, T. Tamura, K. Maenaka, T. Irie, K. Matsuno, S. Tanaka, J. Ito, T. Ikeda, K. Takayama, J. Zahradnik, T. Hashiguchi, T. Fukuhara, K. Sato, G. P. J. G. Consortium, MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY, 2024, ,
  DOI: 10.1111/1348-0421.13165
  
• Akaluc Bioluminescence Offers Superior Sensitivity to Track in Vivo Dynamics of SARS-CoV-2 Infection
  T. Tamura, H. Ito, S. Torii, L. Wang, R. Suzuki, S. Tsujino, A. Kamiyama, Y. Oda, M. Tsuda, Y. Morioka, S. Suzuki, K. Shirakawa, K. Sato, K. Yoshimatsu, Y. Matsuura, S. Iwano, S. Tanaka, T. Fukuhara, Iscience, 2024, 27(5),
  DOI: 10.1016/j.isci.2024.109647
  
• Virological Characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron XBB.1.5 Variant
  T. Tamura, T. Irie, S. Deguchi, H. Yajima, M. Tsuda, H. Nasser, K. Mizuma, A. Plianchaisuk, S. Suzuki, K. Uriu, M. M. Begum, R. Shimizu, M. Jonathan, R. Suzuki, T. Kondo, H. Ito, A. Kamiyama, K. Yoshimatsu, M. Shofa, R. Hashimoto, Y. Anraku, K. T. Kimura, S. Kita, J. Sasaki, K. Sasaki-Tabata, K. Maenaka, N. Nao, L. Wang, Y. Oda, H. Sawa, R. Kawabata, Y. Watanabe, A. Sakamoto, N. Yasuhara, T. Suzuki, Y. Nakajima, Z. Ferdous, K. Shishido, Y. Mugita, O. Takahashi, K. Ichihara, Y. Kaku, N. Misawa, Z. Y. Guo, A. Hinay, Y. Kosugi, S. Fujita, J. M. Tolentino, L. Chen, L. Pan, M. Suganami, M. Chiba, R. Yoshimura, K. Yasuda, K. Iida, N. Ohsumi, A. P. Strange, Y. Shibatani, T. Nishiuchi, S. Tanaka, O. Putri, G. Joas, Y. Kim, D. Yamasoba, K. Yoshimura, K. Sadamasu, M. Nagashima, H. Asakura, I. Yoshida, S. Nakagawa, A. Takaori-Kondo, K. Shirakawa, K. Nagata, R. Nomura, Y. Horisawa, Y. Tashiro, Y. Kawai, T. Ueno, C. Motozono, M. Toyoda, T. Ikeda, A. Saito, K. Matsuno, J. Ito, K. Sato, T. Hashiguchi, K. Takayama, T. Fukuhara, G. P. Genotype Phenotype Japan, Nat. Commun., 2024, 15,
  DOI: 10.1038/s41467-024-45274-3
  

2023年

• Comparative Pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron Subvariants Including BA.1, BA.2, and BA.5
  T. Tamura, D. Yamasoba, Y. Oda, J. Ito, T. Kamasaki, N. Nao, R. Hashimoto, Y. Fujioka, R. Suzuki, L. Wang, H. Ito, Y. Kashima, I. Kimura, M. Kishimoto, M. Tsuda, H. Sawa, K. Yoshimatsu, Y. Yamamoto, T. Nagamoto, J. Kanamune, Y. Suzuki, Y. Ohba, I. Yokota, K. Matsuno, K. Takayama, S. Tanaka, K. Sato, T. Fukuhara, G. P. J. Genotype Phenotype Japan, Communications Biology, 2023, 6, Article number: 772
  DOI: 10.1038/s42003-023-05081-w
  
• Convergent Evolution of SARS-CoV-2 Omicron Subvariants Leading to the Emergence of BQ.1.1 Variant
  J. Ito, R. Suzuki, K. Uriu, Y. Itakura, J. Zahradnik, K. T. Kimura, S. Deguchi, L. Wang, S. Lytras, T. Tamura, I. Kida, H. Nasser, M. Shofa, M. M. Begum, M. Tsuda, Y. Oda, T. Suzuki, J. Sasaki, K. Sasaki-Tabata, S. Fujita, K. Yoshimatsu, H. Ito, N. Nao, H. Asakura, M. Nagashima, K. Sadamasu, K. Yoshimura, Y. Yamamoto, T. Nagamoto, J. Kuramochi, G. Schreiber, A. Saito, K. Matsuno, K. Takayama, T. Hashiguchi, S. Tanaka, T. Fukuhara, T. Ikeda, K. Sato, S. Suzuki, M. Kato, Z. Ferdous, H. Mouri, K. Shishido, N. Misawa, I. Kimura, Y. Kosugi, P. Lin, M. Suganami, M. Chiba, R. Yoshimura, K. Yasuda, K. Iida, N. Ohsumi, A. P. Strange, D. Sauter, S. Nakagawa, J. Q. Wu, Y. Watanabe, A. Sakamoto, N. Yasuhara, Y. Nakajima, H. Yajima, K. Shirakawa, A. Takaori-Kondo, K. Nagata, Y. Kazuma, R. Nomura, Y. Horisawa, Y. Tashiro, Y. Kawa, T. Irie, R. Kawabata, R. Shimizu, O. Takahashi, K. Ichihara, C. Motozono, M. Toyoda, T. Ueno, Y. Shibatani, T. Nishiuchi, G. P. J. Genotype Phenotype Japan, Nat. Commun., 2023, 14, 2671,
  DOI: 10.1038/s41467-023-38188-z
  
• Virological Characteristics of the SARS-CoV-2 XBB Variant Derived from Recombination of Two Omicron Subvariants
  T. Tamura, J. Ito, K. Uriu, J. Zahradnik, I. Kida, Y. Anraku, H. Nasser, M. Shofa, Y. Oda, S. Lytras, N. Nao, Y. Itakura, S. Deguchi, R. Suzuki, L. Wang, M. Begum, S. Kita, H. Yajima, J. Sasaki, K. Sasaki-Tabata, R. Shimizu, M. Tsuda, Y. Kosugi, S. Fujita, L. Pan, D. Sauter, K. Yoshimatsu, S. Suzuki, H. Asakura, M. Nagashima, K. Sadamasu, K. Yoshimura, Y. Yamamoto, T. Nagamoto, G. Schreiber, K. Maenaka, T. Hashiguchi, T. Ikeda, T. Fukuhara, A. Saito, S. Tanaka, K. Matsuno, K. Takayama, K. Sato, G. P. J. Genotype Phenotype Japan, Nat. Commun., 2023, 14, 2671
  DOI: 10.1038/s41467-023-38435-3
  
• Combination Therapy with Bevacizumab and a CCR2 Inhibitor for Human Ovarian Cancer: An in Vivo Validation Study
  T. Y. Zhai, T. Mitamura, L. Wang, S. I. Kubota, M. Murakami, S. Tanaka, H. Watari, Cancer Medicine, 2023, ,
  DOI: 10.1002/cam4.5674
  

2022年

• Germline PRDM1 Variant Rs2185379 in Long-Term Recurrence-Free Survivors of Advanced Ovarian Cancer
  T. Mitamura, T. Zhai, K. C. Hatanaka, Y. Hatanaka, T. Amano, L. Wang, S. Tanaka, H. Watari, Pharmacogenomics & Personalized Medicine, 2022, 15, 977-984
  DOI: 10.2147/pgpm.s387120
  
• Virological Characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Subvariants, Including BA.4 and BA.5
  I. Kimura, D. Yamasoba, T. Tamura, N. Nao, T. Suzuki, Y. Oda, S. Mitoma, J. Ito, H. Nasser, J. Zahradnik, K. Uriu, S. Fujita, Y. Kosugi, L. Wang, M. Tsuda, M. Kishimoto, H. Ito, R. Suzuki, R. Shimizu, M. M. Begum, K. Yoshimatsu, K. T. Kimura, J. Sasaki, K. Sasaki-Tabata, Y. Yamamoto, T. Nagamoto, J. Kanamune, K. Kobiyama, H. Asakura, M. Nagashima, K. Sadamasu, K. Yoshimura, K. Shirakawa, A. Takaori-Kondo, J. Kuramochi, G. Schreiber, K. J. Ishii, T. Hashiguchi, T. Ikeda, A. Saito, T. Fukuhara, S. Tanaka, K. Matsuno, K. Sato, G. P. J. Genotype Phenotype Japan, Cell, 2022, 185, 3992-4007.e16
  DOI: 10.1016/j.cell.2022.09.018
  
• Virological Characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 Variant
  A. Saito, T. Tamura, J. Zahradnik, S. Deguchi, K. Tabata, Y. Anraku, I. Kimura, J. Ito, D. Yamasoba, H. Nasser, M. Toyoda, K. Nagata, K. Uriu, Y. Kosugi, S. Fujita, M. Shofa, M. M. Begum, R. Shimizu, Y. Oda, R. Suzuki, H. Ito, N. Nao, L. Wang, M. Tsuda, K. Yoshimatsu, J. Kuramochi, S. Kita, K. Sasaki-Tabata, H. Fukuhara, K. Maenaka, Y. Yamamoto, T. Nagamoto, H. Asakura, M. Nagashima, K. Sadamasu, K. Yoshimura, T. Ueno, G. Schreiber, A. Takaori-Kondo, K. Shirakawa, H. Sawa, T. Irie, T. Hashiguchi, K. Takayama, K. Matsuno, S. Tanaka, T. Ikeda, T. Fukuhara, K. Sato, G. P. J. Genotype Phenotype Japan, Cell Host & Microbe, 2022, 30, 1540-+
  DOI: 10.1016/j.chom.2022.10.003
  
• Virological Characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2 Spike
  D. Yamasoba, I. Kimura, H. Nasser, Y. Morioka, N. Nao, J. Ito, K. Uriu, M. Tsuda, J. Zahradnik, K. Shirakawa, R. Suzuki, M. Kishimoto, Y. Kosugi, K. Kobiyama, T. Hara, M. Toyoda, Y. L. Tanaka, E. P. Butlertanaka, R. Shimizu, H. Ito, L. Wang, Y. Oda, Y. Orba, M. Sasaki, K. Nagata, K. Yoshimatsu, H. Asakura, M. Nagashima, K. Sadamasu, K. Yoshimura, J. Kuramochi, M. Seki, R. Fujiki, A. Kaneda, T. Shimada, T. Nakada, S. Sakao, T. Suzuki, T. Ueno, A. Takaori-Kondo, K. J. Ishii, G. Schreiber, H. Sawa, A. Saito, T. Irie, S. Tanaka, K. Matsuno, T. Fukuhara, T. Ikeda, K. Sato, Cell, 2022, 185, 2103-+
  DOI: 10.1016/j.cell.2022.04.035
  
• Novel Hydrogel X Induces Cancer Stemness by Involving in Epigenetic Regulation
  J. Suzuka, M. Tsuda, L. Wang, K. Kumegawa, R. Maruyama, S. Tanaka, Cancer Sci., 2022, 113, 747-747
  DOI:
  
• Double Network Hydrogel as Novel Microenvironment Enhances Osteopontin and Reprogramming of Cancer Stem Cells
  S. Tanaka, J. Suzuka, L. Wang, M. Tsuda, Cancer Sci., 2022, 113, 746-746
  DOI:
  
• Aberrant Expression of MYD88 via RNA-Controlling CNOT4 and EXOSC3 in Normal Mucosa Influences Onset of Colonic Cancer
  M. Tsuda, L. Wang, S. Hirano, M. Asaka, S. Tanaka, Cancer Sci., 2022, 113,
  DOI:
  
• Attenuated Fusogenicity and Pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron Variant
  R. Suzuki, D. Yamasoba, I. Kimura, L. Wang, M. Kishimoto, J. Ito, Y. Morioka, N. Nao, H. Nasser, K. Uriu, Y. Kosugi, M. Tsuda, Y. Orba, M. Sasaki, R. Shimizu, R. Kawabata, K. Yoshimatsu, H. Asakura, M. Nagashima, K. Sadamasu, K. Yoshimura, H. Sawa, T. Ikeda, T. Irie, K. Matsuno, S. Tanaka, T. Fukuhara, K. Sato, G. P. J. Genotype Phenotype Japan, Nature, 2022, 603, 700-+
  DOI: 10.1038/s41586-022-04462-1
  
• Novel Rapid Immunohistochemistry Using an Alternating Current Electric Field Identifies Rac and Cdc42 Activation in Human Colon Cancer FFPE Tissues
  M. Tsuda, R. Horio, L. Wang, T. Takenami, J. Moriya, J. Suzuka, H. Sugino, Z. Tanei, M. Tanino, S. Tanaka, Scientific Reports, 2022, 12,
  DOI: 10.1038/s41598-022-05892-7
  

2021年

• Enhanced Fusogenicity and Pathogenicity of SARS-CoV-2 Delta P681R Mutation
  A. Saito, T. Irie, R. Suzuki, T. Maemura, H. Nasser, K. Uriu, Y. Kosugi, K. Shirakawa, K. Sadamasu, I. Kimura, J. Ito, J. Q. Wu, K. Iwatsuki-Horimoto, M. Ito, S. Yamayoshi, S. Loeber, M. Tsuda, L. Wang, S. Ozono, E. P. Butlertanaka, Y. L. Tanaka, R. Shimizu, K. Shimizu, K. Yoshimatsu, R. Kawabata, T. Sakaguchi, K. Tokunaga, I. Yoshida, H. Asakura, M. Nagashima, Y. Kazuma, R. Nomura, Y. Horisawa, K. Yoshimura, A. Takaori-Kondo, M. Imai, S. Tanaka, S. Nakagawa, T. Ikeda, T. Fukuhara, Y. Kawaoka, K. Sato, G. P. J. Genotype Phenotype Japan, Nature, 2021, 602, 300-+
  DOI: 10.1038/s41586-021-04266-9
  
• Hydroxyapatite-Hybridized Double-Network Hydrogel Surface Enhances Differentiation of Bone Marrow-Derived Mesenchymal Stem Cells to Osteogenic Cells
  T. Kaibara, L. Wang, M. Tsuda, T. Nonoyama, T. Kurokawa, N. Iwasaki, J. P. Gong, S. Tanaka, K. Yasuda, Journal of Biomedical Materials Research Part A, 2021, 110, 747-760
  DOI: 10.1002/jbm.a.37324
  
• Aberrant Expression of MYD88 via RNA-Controlling CNOT4 and EXOSC3 in Colonic Mucosa Impacts Generation of Colonic Cancer
  M. Tsuda, M. Noguchi, T. Kurai, Y. Ichihashi, K. Ise, L. Wang, Y. Ishida, M. Tanino, S. Hirano, M. Asaka, S. Tanaka, Cancer Sci., 2021, 112, 5100-5113
  DOI: 10.1111/cas.15157
  
• Fast in Vivo Fixation of Double Network Hydrogel to Bone by Monetite Surface Hybridization
  T. Nonoyama, L. Wang, R. Kiyama, N. Kashimura, K. Yasuda, S. Tanaka, T. Kurokawa, J. P. Gong, Journal of the Ceramic Society of Japan, 2021, 129, 584-589
  DOI: 10.2109/jcersj2.21084
  
• Involvement of BMP and Wnt Signals Leading to Epithelial-Mesenchymal Transition in Colon Adenocarcinoma with Heterotopic Ossification
  N. Katono, M. Tsuda, J. Suzuka, Y. Oda, L. Wang, Z. Tanei, M. Tanino, T. Ohata, E. Nagabuchi, Y. Ishida, S. Kimura, T. Iwanaga, S. Tanaka, Annals of Clinical and Laboratory Science, 2021, 51, 271-276
  DOI:
  
• Rapid Reprogramming of Tumour Cells into Cancer Stem Cells on Double-Network Hydrogels
  J. Suzuka, M. Tsuda, L. Wang, S. Kohsaka, K. Kishida, S. Semba, H. Sugino, S. Aburatani, M. Frauenlob, T. Kurokawa, S. Kojima, T. Ueno, Y. Ohmiya, H. Mano, K. Yasuda, J. P. Gong, S. Tanaka, Nature Biomedical Engineering, 2021, , 15
  DOI: 10.1038/s41551-021-00692-2